La Abadía de Alet-les-Bains fue construida en el siglo IX por el conde de Razés "Bera" porque estaba ansioso por controlar su condado. El abad Benoît de Saint-Hilaire fue el primer abad que se conoce en el santuario.

​

Los abades se sucedieron hasta 1318 cuando la ciudad de Alet-les-Bains fue nombrada obispado. La iglesia de la abadía se convirtió entonces en una catedral gótica y el padre Bartolomé fue nombrado primer obispo de la catedral.

​

Las guerras de religión durante el siglo XVI, derruyeron la abadía de la que sólo quedan ruinas.

​

Durante el siglo XIX, Prosper Mérimée intentó, en vano, hacer clasificar la Abadía de Alet-les-Bains como monumento histórico. Hubo que esperar hasta el siglo XX para que se tomaran las primeras medidas de protección y que la abadía fuese clasificada como monumento histórico.